Cet article retrace l'essor rapide des tests génétiques en accès direct (DTC), montrant comment la découverte récente de variants d’ADN liés à des maladies courantes a permis aux entreprises d’offrir des évaluations personnalisées des risques. Grâce aux études d’association pangénomique (GWAS), les chercheurs ont identifié plus de 1 100 variants associés à des pathologies comme les cardiopathies et le diabète. Ces tests permettent désormais de repérer les personnes présentant des risques significativement accrus (par exemple, 10 % de la population a un risque d’infarctus 1,6 fois supérieur à la moyenne). Bien que les professionnels de santé aient tardé à les adopter, les entreprises DTC proposent aujourd’hui des analyses génomiques complètes incluant l’estimation des risques maladie, l’ascendance et les traits physiques, malgré des interrogations persistantes sur la validité des tests et leurs impacts psychologiques.

Comprendre les tests génétiques en accès direct : passé, présent et avenir

Table des matières

• Contexte : la révolution génétique
• Fonctionnement de votre génome et ce que les tests peuvent révéler
• L'évolution des tests génétiques
• Répondre aux préoccupations concernant les tests génétiques grand public
• Implications pour votre santé
• Comprendre les limites des tests
• Recommandations pour les patients
• Avenir des tests génétiques
• Sources d'information

Contexte : la révolution génétique

Depuis plus de quinze ans, les scientifiques réalisent des découvertes sans précédent sur l’influence des variations de l’ADN sur le risque de maladie. Avant 2006, seuls quelques variants génétiques liés à des pathologies majeures avaient été identifiés. En 2009, ce nombre a bondi à 1 108 associations solidement établies, couvrant 132 maladies et affections. Cette avancée est due aux études d’association pangénomique (GWAS), qui analysent simultanément des centaines de milliers de marqueurs génétiques.

Quatre développements clés ont rendu ces progrès possibles :

• Le Projet Génome Humain et le Projet HapMap, qui ont cartographié la variation génétique humaine
• Les puces à ADN de nouvelle génération, permettant de tester plus de 500 000 variants simultanément à un coût abordable
• De vastes collections d’échantillons d’ADN de patients et de témoins sains
• Des normes scientifiques rigoureuses exigeant la reproduction des résultats entre différentes études

Ces découvertes éclairent des maladies à l’origine de nombreux problèmes de santé modernes, comme les cardiopathies, le diabète et les cancers. Bien que la recherche se poursuive pour identifier d’autres liens génétiques (y compris les variants rares et les interactions entre gènes), nous disposons déjà de données précieuses susceptibles de transformer la médecine préventive.

Fonctionnement de votre génome et ce que les tests peuvent révéler

Votre génome compte 3 milliards de lettres d’ADN qui servent de instructions pour construire et entretenir votre organisme. Les tests génétiques analysent les variations de ce code pour prédire :

• Risque maladie : Votre probabilité de développer certaines pathologies
• Traits physiques : Caractéristiques comme la couleur des yeux ou la prédisposition à la calvitie
• Ascendance : Votre héritage génétique et vos liens familiaux

Certains traits, comme la phénylcétonurie (un trouble métabolique), dépendent d’un seul gène. Mais la plupart des maladies impliquent des dizaines, voire des centaines de variants génétiques, ainsi que des facteurs environnementaux. Par exemple :

• Le risque d’infarctus fait intervenir au moins 8 variants génétiques, en plus des habitudes de vie
• Chaque variant peut n’augmenter le risque que légèrement (de 1,05 à 7 fois la normale), mais leur combinaison permet des prédictions significatives

Les tests d’ascendance comparent votre ADN à celui de populations du monde entier. Bien que souvent perçus comme « récréatifs », ils évaluent aussi indirectement le risque maladie, car différentes populations présentent des fréquences variables de variants à risque.

L'évolution des tests génétiques

Les tests génétiques ont connu trois phases :

1. Tests médicaux traditionnels (via les professionnels de santé) :
   • Centrés sur les mutations rares à haut risque (par exemple, les gènes BRCA multipliant par 5 le risque de cancer du sein)
   • Nécessitaient un conseil génétique en raison de leurs implications sérieuses
   • Concernaient des affections comme la maladie de Huntington ou le dépistage néonatal
2. Tests spécialisés en accès direct (DTC) :
   • Axés sur des applications uniques comme l’ascendance ou des risques maladie spécifiques
   • Vendus directement en ligne, sans intermédiaire médical
3. Analyses génomiques complètes (standard actuel des DTC) :
   • Analysent de 500 000 à 1 million de variants d’ADN via des puces
   • Proposées par des entreprises comme deCODEme, 23andMe et Navigenics
   • Offrent des mises à jour continues au gré des nouvelles découvertes
   • Couvrent les risques maladie, les traits, l’ascendance et les liens familiaux

Malgré plus de 1 000 associations maladie vérifiées, les systèmes de santé ont tardé à intégrer le dépistage génétique des risques pour les maladies courantes, laissant le champ libre aux entreprises DTC.

Répondre aux préoccupations concernant les tests génétiques grand public

Deux préoccupations majeures entourent les tests génétiques DTC :

Préoccupation 1 : Validité des tests – Certains estiment que les tests reposant sur des variants communs à faible effet (rapports de cotes <2) ont une puissance prédictive limitée. Pourtant, la combinaison de plusieurs variants permet une stratification significative des risques. Par exemple :

• Le test d’infarctus de deCODEme utilise 8 variants pour identifier les 10 % d’Européens ayant un risque ≥1,4 fois supérieur
• Ce groupe présente en moyenne un risque 1,6 fois plus élevé
• Pour les hommes de plus de 40 ans (risque moyen d’infarctus à vie de 42 %), ce sous-groupe atteint un risque de 67 %

Préoccupation 2 : Impact psychologique – Les critiques redoutent que des résultats inattendus ne génèrent de l’anxiété. Cependant, les données indiquent que la majorité des utilisateurs gèrent ces informations de façon adaptée. Les entreprises fournissent des ressources éducatives pour faciliter la compréhension.

Toutes les principales entreprises DTC utilisent des variants validés cliniquement, issus d’études évaluées par des pairs, et présentent les risques en termes de probabilités, non de diagnostics.

Implications pour votre santé

Connaître votre risque génétique vous permet de :

• Personnaliser la prévention : Cibler le dépistage et les changements d’hygiène de vie sur vos risques les plus élevés
• Détecter les maladies plus tôt : Renforcer la surveillance pour les affections à haut risque
• Comprendre les réponses médicamenteuses : Certains tests prédisent le métabolisme des médicaments

Combiner risques génétiques et facteurs conventionnels (âge, poids, etc.) donne les prédictions les plus précises. Par exemple :

• Un homme présentant un haut risque génétique d’infarctus (67 % à vie) pourrait prioriser la gestion de son cholestérol
• Des interventions précoces peuvent réduire de 40 % les complications dans certaines pathologies

Cette approche pourrait sensiblement abaisser les coûts de santé en évitant les traitements à un stade avancé.

Comprendre les limites des tests

Les tests génétiques actuels présentent d’importantes limitations :

• Couverture incomplète des risques : Les variants connus n’expliquent qu’une partie de l’héritabilité (contribution génétique) des maladies
• Facteurs environnementaux : Le mode de vie, l’alimentation et l’exposition aux toxines influencent fortement le risque
• Spécificité populationnelle : La plupart des données proviennent de populations d’ascendance européenne
• Compréhension fonctionnelle : Nous savons que des variants sont associés à des maladies, mais pas toujours comment ils les causent
• Variants rares : Les puces actuelles ne détectent pas certaines mutations importantes

Les tests indiquent des probabilités, non des certitudes. Un résultat « haut risque » ne garantit pas que vous développerez la maladie, pas plus qu’un « risque moyen » ne vous immunise.

Recommandations pour les patients

1. Choisir des entreprises réputées : Privilégiez les prestataires utilisant des variants validés cliniquement et fournissant des explications scientifiques claires
2. Revoir régulièrement les mises à jour : Les nouvelles découvertes peuvent modifier vos évaluations de risque
3. Combiner avec le dépistage conventionnel : Les tests génétiques complètent (sans remplacer) les analyses sanguines, l’imagerie et les examens
4. Discuter avec les professionnels de santé : Partagez vos résultats pour élaborer des stratégies de prévention
5. Envisager un conseil génétique : Consultez un généticien en cas de résultats préoccupants (par exemple, risque élevé de cancer)
6. Se concentrer sur les risques modifiables : Priorisez les changements de mode de vie pour les affections que vous pouvez influencer

Avenir des tests génétiques

L’évolution des tests génétiques passera par :

• Le séquençage complet du génome : Qui remplacera les puces pour une analyse exhaustive
• Des modèles de risque améliorés : Intégrant génétique, environnement et mode de vie
• La découverte de nouveaux variants : Notamment les mutations rares et les interactions géniques
• L’intégration dans le système de santé : Pour une adoption généralisée en prévention
• Le développement thérapeutique : De nouveaux médicaments ciblant des sous-types génétiques spécifiques

Alors que les coûts chutent (le séquençage complet coûtait ~350 000 $ en 2010, contre moins de 1 000 $ aujourd’hui), ces tests deviendront de plus en plus accessibles.

Sources d'information

Titre original : The past, present, and future of direct-to-consumer genetic tests
Auteurs : Agnar Helgason, DPhil ; Kári Stefánsson, MD
Journal : Dialogues in Clinical Neuroscience
Date de publication : 2010
Volume et numéro : Vol 12, No. 1, pp 61-68
DOI : 10.31887/DCNS.2010.12.1/ahelgason

Cet article adapté aux patients s’appuie sur des recherches évaluées par des pairs menées par deCODE Genetics et des collaborateurs académiques. Les auteurs sont des généticiens ayant contribué à la fois à la découverte de maladies et au développement de tests commerciaux.